iTRAQ多重化学标记串联质谱技术在比较蛋白质组学中的应用
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篇1：iTRAQ多重化学标记串联质谱技术在比较蛋白质组学中的应用
iTRAQ多重化学标记串联质谱技术在比较蛋白质组学中的应用
研究不同生理和病理条件下细胞内蛋白质的含量和状态变化是比较蛋白质组学的核心内容.要揭示上述动态过程往往需要进行多个样品的同步比较分析.近年来,在体内和体外同位素标记基础上,用多维液相色谱分离多肽,进而用串联质谱进行相对定量的.分析方法已成为高通量比较蛋白质组研究的主要手段之一.该文就目前唯一一种可以进行四重蛋白质样品同步比较的iTRAQ标记-串联质谱分析技术进行综述.
作 者：李伟 LI Wei 作者单位：上海交通大学生命学院系统生物研究所,上海,40 刊 名：生命的化学 ISTIC PKU英文刊名：CHEMISTRY OF LIFE 年，卷(期)： 26(5) 分类号：Q5 关键词：比较蛋白质组学 iTRAQ 多维液相色谱 串联质谱 多重同步分析篇2：基于质谱技术的计算蛋白质组学研究
基于质谱技术的计算蛋白质组学研究
蛋白质组是继人类基因组计划完成之后又一新兴的生命科学研究对象,蛋白质组学研究细胞或组织内所有表达的蛋白质. 生物质谱技术已为蛋白质组学研究产生了大规模的.质谱数据; 而如何从这些数据中提取和发现有关蛋白质组的重要生物学知识为计算蛋白质组学的研究提出了重大需求, 如蛋白质鉴定、翻译后修饰、定量分析, 以及疾病模式的发现等. 本文研究了如何应用计算技术来解决蛋白质组学研究中质谱信息处理的这几个关键问题.
作 者：孙瑞祥 付岩 李德泉 张京芬 王晓彪 盛泉虎 曾嵘 陈益强 贺思敏 高文 作者单位：孙瑞祥,陈益强,贺思敏(中国科学院计算技术研究所,北京,100080)付岩,李德泉,张京芬,王晓彪,高文(中国科学院计算技术研究所,北京,100080;中国科学院研究生院,北京,100039)
盛泉虎,曾嵘(中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所,上海,31)
刊 名：中国科学E辑 ISTIC PKU英文刊名：SCIENCE IN CHINA SERIES E:INFORMATION SCIENCES 年，卷(期)：2006 36(2) 分类号：Q5 关键词：计算蛋白质组学 质谱技术 蛋白质鉴定 算法 生物信息学篇3：蛋白质组学技术在感染研究中的应用
蛋白质组学技术在感染研究中的应用
蛋白质组学的目标在于阐明特定生物体、组织、细胞或亚细胞结构中全部蛋白质的'表达模式和功能模式,其技术平台由高通量的蛋白质分离技术、鉴定技术和生物信息学组成.在许多研究领域,蛋白质组学技术为阐明疾病过程和生命现象的分子机制提供了全面、网络和动态的蛋白质组信息.感染是重要的基本致病因素之一,蛋白质组学的研究策略和技术方法有利于快速分离鉴定病原体蛋白质组、宿主免疫细胞蛋白质组、感染相关蛋白、疫苗候选抗原蛋白、生物标志物和药物靶标,从而明显加快病原体、宿主反应、感染发病机制以及感染预防、诊断和治疗等相关研究的进程.
作 者：徐发良 龚建平XU Fa-Liang GONG Jian-Ping 作者单位：重庆医科大学附属第二医院肝胆外科,重庆,400010 刊 名：生理科学进展 ISTIC PKU英文刊名：PROGRESS IN PHYSIOLOGICAL SCIENCES 年，卷(期)： 37(4) 分类号：Q5 关键词：蛋白质组 蛋白质组学 感染 二维凝胶电泳 质谱篇4：蛋白质组研究中离子阱串联质谱数据搜库结果解释方法
蛋白质组研究中离子阱串联质谱数据搜库结果解释方法
基于离子阱串联质谱仪的鸟枪法是一种高通量的蛋白质鉴定方法.得到的数据一般使用软件SE-QUEST搜索蛋白质序列数据库,得到肽段鉴定列表以及相应的打分.为了得到蛋白质鉴定列表,还需要进行肽段鉴定结果的`过滤和假阳性率的计算,然后根据肽段鉴定结果组装蛋白质列表.这两个问题目前还没有很好地解决.对已有的方法进行总结和比较,可以给搜库结果解释方法的选择提供参考,对数据质量控制方法的改进也有所帮助.
作 者：张纪阳 朱云平谢红卫 贺福初 ZHANG Ji-yang ZHU Yun-ping XIE Hong-wei HE Fu-chu 作者单位：张纪阳,谢红卫,ZHANG Ji-yang,XIE Hong-wei(国防科学技术大学机电工程与自动化学院,长沙,410073)朱云平,贺福初,ZHU Yun-ping,HE Fu-chu(军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京,100850;北京蛋白质组研究中心,北京,102206)
刊 名：生物物理学报 ISTIC PKU英文刊名：ACTA BIOPHYSICA SINICA 年，卷(期)：2006 22(4) 分类号：Q5 关键词：SEQUEST 离子阱串联质谱 数据质量控制 蛋白质鉴定篇5：蛋白质组学在昆虫学研究中应用进展
蛋白质组学在昆虫学研究中应用进展
蛋白质组学已成为现代生命科学领域中的`热点之一,在昆虫学研究中也得到了越来越多的应用.本文就其在昆虫学研究中应用的一些新进展作了综述.最后,提出昆虫蛋白质组学研究中存在的问题,并分析了其发展前景.
作 者：方琦 姚洪渭 叶恭银 FANG Qi YAO Hong-wei YE Gong-yin 作者单位：浙江大学,水稻生物学国家重点实验室,昆虫科学研究所,浙江,杭州,310029 刊 名：浙江农业学报 ISTIC PKU英文刊名：ACTA AGRICULTURAE ZHEJIANGENSIS 年，卷(期)： 18(6) 分类号：Q966 关键词：蛋白质组学 昆虫学 应用 进展篇6：蛋白质组学及其在肿瘤研究中的应用
蛋白质组学及其在肿瘤研究中的应用
简要介绍了蛋白质组学的概念、研究方法及其在肿瘤研究中的.应用.蛋白质组学研究直接定位于蛋白质水平，从整体、动态、定量的角度去研究基因 的功能，是后基因组计划的一个重要组成部分.恶性肿瘤是一种多基因参与的复杂疾病，从蛋 白质整体水平上研究恶性肿瘤将有助于进一步揭示恶性肿瘤的发病机制，发现恶肿瘤特异性的标志物及其药物治疗的靶标.
作 者：李峰 关勇军 陈主初 LI Feng GUAN Yong-jun CHEN Zhu-Chu 作者单位：湖南医科大学肿瘤研究所，长沙 410078 刊 名：生物化学与生物物理进展 ISTIC SCI PKU英文刊名：SHENGWUHUAXUE YU SHENGWUWULI JINZHAN 年，卷(期)： 28(2) 分类号：Q71 关键词：蛋白质组学 恶性肿瘤 研究 proteomics cancer research篇7：双向电泳技术在蛋白质组学中的应用
双向电泳技术在蛋白质组学中的应用
双向电泳技术在蛋白质组学研究领域中一直处于核心地位.此文从基本原理、方法、在蛋白质组中的应用以及方法的'局限性和相关技术改进等方面做了简要综述,为进一步开发利用该技术提供参考依据.
作 者：李倩 于振 江帆 彭永康 LI Qian YU Zhen JIANG Fan PENG Yong-kang 作者单位：天津师范大学,化学与生命科学学院、细胞遗传与分子调控天津市重点实验室,天津,300387 刊 名：实验室科学 英文刊名：LABORATORY SCIENCE 年，卷(期)：2009 “”(2) 分类号：Q291 关键词：双向电泳 蛋白质组学 应用
